2000年后，深圳市科协有了进一步的发展。截至2005年8月，深圳市、区、街道科协组织发展到42个，国家、省、市级科普教育基地31个，市级学会58个，会员8万多人。

    市科协是市科技工作者的群众组织，是中共深圳市委领导下的人民团体，其宗旨是团结组织科技工作者以经济建设为中心，促进科学技术的繁荣和发展，促进科学技术的普及和推广，促进科技人才的成长和提高，维护科技工作者的合法权益，为科技工作者和科技团体服务。市科协的主要任务是进行科普宣传，开展学术研究，进行科技培训，开展科技咨询，加强所属团体之间的联系，培养、表彰、举荐科技人才。